Search or add a thesis

Advanced Search (Beta)
Home > Microbiology and Phage Therapy of Diabetic Foot Ulcer

Microbiology and Phage Therapy of Diabetic Foot Ulcer

Thesis Info

Access Option

External Link

Author

Chaudhry, Waqas Nasir

Program

PhD

Institute

National University of Sciences & Technology

City

Islamabad

Province

Islamabad

Country

Pakistan

Thesis Completing Year

2015

Thesis Completion Status

Completed

Subject

Applied Sciences

Language

English

Link

http://prr.hec.gov.pk/jspui/bitstream/123456789/8390/1/Waqas_Nasir_Chaudhry_HSR_Virology_%26_Immunology_2017_NUST_ISD_21.11.2017.pdf

Added

2021-02-17 19:49:13

Modified

2024-03-24 20:25:49

ARI ID

1676726641816

Similar


Diabetic foot infections (DFI) are a major complication of diabetes mellitus. It contributes to the development of gangrene and non-traumatic lower extremity amputations with the life time risk up to 25 %. Since bacteria responsible for chronic wound infections are commonly within polysaccharide matrices known as biofilms, which to a large extent are refractory to antibiotics even when the bacteria are genetically susceptible to their action. In the first part of the study, we identified the neuropathy, ulcer grade, microbial profile, phenotypic and genotypic resistance prevalence of methicillin and ESBL genes in bacterial isolates of DFI patients registered at PIMS, Pakistan. Our results indicated that 46 (92 %) out of 50 patients, had sensory neuropathy. The most prevelant isolate was Staphylococcus aureus (25 %), followed by Pseudomonas aeruginosa (18.18%), E. coli (16.16%), Streptococcus spp (15.15%), Enterococcus spp (9%), Proteus spp (15.15%) and Klebsiella pneumonia (3%). The prevalence of MecA gene was found to be 88 % and 84% phenotypically and genotypically respectively. K. pneumonia had highest percentage of ESBL producers with 66.6 % prevalence by double disc synergy test and 100 % for CTX+CL/CAZ+CL by combination disc test. Pseudomonas aeruginosa had highest (100 %) number of metalo β-lactamase producers by EDTA synergy disk test. Overall prevalence of bla-CTX-M, bla-CTX-M15, bla-TEM, bla-OXA and bla-SHV genes was found to be 76.92, 76.92, 75.0, 57.69 and 84.6 % respectively in gram negative isolates from DFI. Molecular epidemiology of MecA and ESBL genes were found alarmingly high in DFI, posing one of the major cause of antibiotic treatment failure. In the second part of our study we determined whether combinations of antibiotics and bacteriophage were more effective for the treating biofilm populations of Abstract xvii Pseudomonas aeruginosa [the laboratory strain PA14, and the clinical strain, CFBR2)] on plastic surfaces and layers of human epithelial cells. Two newly isolated bacteriophage NP1 and NP3 at a titer of ~1E8 pfu/ml were added individually or as pairs and/or in combination with 1X MIC, 4XMIC and 8X MIC of ceftazidime, colistin, gentamicin or trobramycin to 48 hours PA biofilms in 6 well polystyrene plates. Parallel experiments were performed with 8-hour biofilm populations of epithelial Naso pharyngeal Detroit 562 (ATCC® CCl-138TM). Treatment with phage reduces the viable density of biofilm populations of P. aeruginosa. biofilms by three orders of magnitude as compared to untreated control. In combination with antibiotics phages are more effective than alone and increase efficacy of the antibiotics for treating bacteria in biofilms. In the third part of study we explored co-evolutionary dynamics of resistance between Pseudomonas aeruginosa 14 and its phages NP1 and NP3. Evolutionary dynamics experiments of single and two phages revealed that PA14 can easily evolve resistance against NP1 phage. NP3 phage maintained for 30 serial transfers and we observed host range in evolved bacteria. In cocktail, both phage support each for their long term maintenance in serial transfer experiments. Also, cocktail delayed the evolution of resistance and sustained high phage infectivity, suggesting phage cocktail is promising strategy to control or slow down evolution of resistance in bacteria against bacteriophages.
Loading...

Similar Thesis

Showing 1 to 20 of 100 entries
TitleAuthorSupervisorDegreeInstitute
PhD
National University of Sciences & Technology, Islamabad, Pakistan
PhD
University of Karachi, Karachi, Pakistan
Mphil
Quaid-i-Azam University, Islamabad, Pakistan
PhD
University of the Punjab, Lahore, Pakistan
University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore, Pakistan
MS
Riphah International University, Lahore, Pakistan
PhD
University of the Punjab, Lahore, Pakistan
PhD
University of the Punjab, Lahore, Pakistan
PhD
University of the Punjab, Lahore, Pakistan
Riphah International University, Lahore, Pakistan
MS
Riphah International University, Islamabad, Pakistan
PhD
Quaid-I-Azam University, Islamabad, Pakistan
MS
Riphah International University, Lahore, Pakistan
Mphil
Riphah International University, Faisalabad, Pakistan
Mphil
Quaid-i-Azam University, Islamabad, Pakistan
PhD
Quaid-I-Azam University, Islamabad, Pakistan
PhD
University of Agriculture, Faisalabad, Pakistan
PhD
University of Agriculture, Faisalabad, Pakistan
PhD
University of Agriculture, Faisalabad, Pakistan
PhD
University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore, Pakistan
TitleAuthorSupervisorDegreeInstitute
Showing 1 to 20 of 100 entries

Similar Books

Loading...

Similar Chapters

Loading...

Similar News

Loading...

Similar Articles

Loading...

Similar Article Headings

Loading...

شاعرصدیقی کا اختصاص

شاعر صدیقی کا اختصاص
دبستان کراچی کے شعری اْفق پر اْبھرنے والے ادباء و شعرانے اْردو شعری اور نثر ی ادب کے سرمایے میں ناقابل فراموش حصہ ڈالاہے۔جن میں اُن شعرا کا بھی اہم کردار رہا ہے جنہوں نے برصغیر کے مختلف علاقوں سے ہجرت کرکے سرزمین پاکستان سے اپنی بے لوث محبت کا ثبوت دیا ۔شاعری کے میدان کے شہسواروں میں ایک اہم نام شاعرؔصدیقی کابھی ہے جنہوں نے محض ایک صنفِ سخن کو اپنی پہچان نہیں بنایا بلکہ ہرصنف میں خودکو ایک اعلیٰ درجے کا شاعر ثابت کیا ہے۔
شاعرؔصدیقی کی پرورش کلکتے کے ادبی ماحول میں ہوئی جہاں اْنہیں وطن کے معروف شعرا کی صحبت میں بیٹھے کا موقعہ ملا اور بہت کم سنی میں شاعری کی طرف مائل ہوئے۔اْن کے ابتدائی کلام میں ایک پختہ کار سخن ورکے آثار نظر آنے لگے جس کے سبب سے وہ بہت جلد مشہور ہونے کے ساتھ ساتھ مقبول بھی ہوئے اور اْن کی غزلیں مختلف ادبی جرائد میں شائع ہونے لگیں۔پاکستان بننے کے بعد شاعر نے ۱۹۵۰ء میں کلکتہ سے ڈھاکا ہجرت کی اوریہاں پہ سرکاری ملازمت کے ساتھ صحافت اور فلمی دنیا سے بھی وابستہ ہوگئے۔یہاں سے اْن کی شاعری کا دوسرا اورسنہرا دور شروع ہوتا ہے اس دورمیںاُن کی شاعری فکروفن کی پختگی کو پہنچی ہے۔ڈھاکا میں وہ ایک ممتاز شاعر،ادیب اور صحافی کی حیثیت سے مشہور ہوگئے۔فلم انڈسٹری کے لیے اْنہوں نے جو گیت لکھے وہ چار دانگ ِعالم مشہورہو ئے۔شاعرؔصدیقی کاشمار ۱۹۷۱ئسے قبل مشرقی پاکستان کے مقبول گیت نگاروں میں ہوتا تھا۔
سانحہ مشرقی پاکستان کے بعد شاعرؔصدیقی نے اپنے اہل و عیال کے ساتھ نیپال سے ہوتے ہوئے کراچی ہجرت کی جو اْن کی زندگی کا سب سے بڑا سانحہ تھا کیوں کہ گھر بار اجڑنے کے ساتھ ساتھ اْن کا شعری اور نثری سرمایہ بھی اْس سانحہ کی نظر ہوگیا۔کراچی...

النفوذ السوفيتي في إيران خلال الحرب العالمية الثانية 1939-1945

تهدف الدراسة الى معرفة طبيعة التنافس الدولي حول إيران بحكم موقعها الجغرافي المميز الذي يشكل حلقة وصل بين معسكرين متباينين، الدول الأوربية والولايات المتحدة الامريكية من جهة والاتحاد السوفيتي من جهة ثانية خلال الحرب العالمية الثانية عدت إيران ذات أهمية استثنائية في ظل السياسة الدولية أثناء الحرب العالمية الثانية، لا لموقعها الجغرافي المهم حسب بل انها أصبحت جزءاً لا يتجزأ من تلك السياسة، التي شكلت صراعاً مريراً وتنافساً كبيراً بين دول الحلفاء والمحور خلال تلك الحرب، وبشكل خاص بعد الهجوم الألماني على الاتحاد السوفيتي في 22 حزيران 1941 التي أخذت تطورا خطيرا في أحداث العالم بأسره. وقد اعتمد الباحث في دراسته على المنهج التاريخي الحديث حيث تابع تطور الأحداث العسكرية والعلاقات السياسية والاقتصادية بين الجانبين تاريخياً. ومن أهم النتائج التي أفرزتها الدراسة: عدم الاستقرار في العلاقات السياسية والاقتصادية بين روسيا وإيران بسبب ضغوطات الدول الأجنبية وتدخلها في الشؤون الداخلية لإيران.

A Smart Methodology for Handling Missing Data in Time Series Datasets

Missing information or missing data occurs when no data value is stored for any variable in the dataset. It is usually occurred and can have a substantial effect on the decisions. These days the treatment of the missing data is a real issue. In data quality, a severe threat is missing data which have a direct impact on the certainty of what is being presented to the end user. Imputation of missing values from predictive strategies created the idea that the influences accredited have some association with actual data. If these values did not have an association with actual data, it could produce uncertain results. There are different factual strategies of machine learning techniques like neural systems; genetic programming, and data mining strategies, which are utilized to impute such missing perceptions. In data analytics, predictive methodologies are exceptionally attractive because it can prompt better results. If there are missing data values in datasets certain machine algorithms cannot be applied to predict and forecast data. We can use different time series datasets of different organizations listed in the Pakistan Stock Exchange (PSX). The missing values can be discovered in these selected datasets. We have developed algorithms that can fill the missing dates in the datasets because some of the forecasting algorithms did not initially predict with missing values. The datasets with none missing values can be used for the training of some machine learning algorithms. The results based on different datasets of PSX can be used to forecast the next day value of the stock.